Всички надземни части на картофеното растение, както и неузрелите картофи съдържат високо отровния алкалоид соланин.
В особено голяма концентрация той се съдържа и в раззеленилите се от светлината части, и в кълновете на картофите. Затова неузрелите и зелените картофи трябва да бъдат изхвърлени и кълновете да бъдат грижливо изрязвани преди използване.
При позеленелите картофи обелката трябва да бъде грижливо изрязвана и при варене да се използва много вода.
При правилна консумация образуването на соланин се изгубва с времето.
За намаляване на образуването на кълнове често се използват средства за тази цел (например профам, хлорпрофам). Средното съдържание на остатъци в картофите обаче е далеч под законната стойностна граница. Според страната, от която произлизат грудките, те също се облъчват, за да се намали образуването на кълнове. Освен това в конвенционалното култивиране при посяване се използват пестициди, от които биологичното земеделие се е отказало.
Картофите са относително бедни на нитрати.